Rédigé par Jeffrey S. Buyerune,*, Laurie E. Eau potableb
Abstract
Deux méthodes de caractérisation des communautés microbiennes dans des échantillons de sol de terrain ont été comparées. Des sous-parcelles expérimentales ont été établies lors de l'essai des systèmes agricoles Rodale Institute Centre de recherche à Kutztown, PA, USA. Dans le système des légumineuses, les parcelles recevant de l'engrais vert (vesce velue) ont été comparées à celles recevant des tiges de maïs et une petite quantité de résidus de seigle. Dans le système conventionnel, des échantillons ont été prélevés dans des parcelles où des tiges de maïs étaient incorporées. Les profils d'utilisation des sources de carbone ont été élaborés à l'aide de plaques Biolog, tandis que les acides gras totaux du sol ont été déterminés par analyse des esters méthyliques d'acides gras. L'analyse en composantes principales et l'analyse discriminante canonique ont été utilisées pour analyser les données. Les deux méthodes ont donné des résultats similaires mais non identiques. Les antécédents de gestion avaient plus d'effet que les résidus de cultures spécifiques, mais les effets temporels étaient plus importants que les effets du traitement. Certains changements dans les communautés microbiennes ont été détectés par l'analyse des acides gras mais pas par l'analyse de l'utilisation du carbone, ce qui suggère que des changements dans la composition des espèces microbiennes se sont produits qui n'étaient pas accompagnés de changements dans la fonction de la communauté microbienne.