王华龙着1,2,乌鸦·比尔3†劳拉(Laura Zgleszewski)3,马克·佩波克3,伊曼纽尔·奥蒙迪(Emmanuel Omondi)4†,阿塔努·穆克吉(Atanu Mukherjee)4†陈锋2张传伦5,6,7 和靳进军3,6,8 *

抽象

除了居住在极端地区之外,古细菌广泛分布在从陆地到水生环境的普通环境中。 这项研究调查并比较了三种不同生境(代表不同环境)的古细菌群落结构:农业土壤(来自美国宾夕法尼亚州FST的农作系统试验),淡水生物膜(来自美国宾夕法尼亚州白粘土溪)和河口水(美国切萨皮克湾)。 16S rRNA基因的高通量测序表明,在这三个环境中,常见的主要菌群有伞形目,Euryarchaeota,Nanoarchaeota,Crenarchaeota和Diapherotrites。 与细菌相似,在土壤与淡水与河口之间观察到古细菌的独特群落结构和分布模式。 但是,土壤中古细菌群落的丰富度,丰富性,均匀性和多样性要比淡水和河口环境中的丰富得多。 从土壤中的不同氮和碳循环古细菌群体(亚硝基球菌,亚硝基牛,亚硝基孢子,甲烷菌,硅拟球藻,Lainarchaeales),淡水生物膜(甲细菌,亚硝基球菌,白蜡球菌((属) ),表明它们对不同环境的生物地球化学贡献的生境特异性。 功能预测(PICRUSt2分析)也证实了古细菌的不同功能方面。 此外,共现网络分析表明,只有土壤古细菌形成了稳定的模块。 主要从甲烷菌,亚硝基球菌,亚细孢子虫中鉴定出主要的树种(ASV)。 总体而言,这些结果表明古生菌及其栖息地在当地环境中的分布取决于栖息地。

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1:中国海洋大学海洋生命科学学院,青岛
2:美国马里兰大学巴尔的摩市马里兰大学环境科学中心海洋与环境技术研究所
3:美国宾夕法尼亚州埃文代尔斯特劳德水研究中心微生物学部
4: Rodale Institute,库兹敦,宾夕法尼亚州,美国
5:南方科技大学海洋科学与工程系,深圳
6:南方科技大学,深圳海洋古生物地球组学重点实验室,深圳
7:南方海洋科学与工程广东实验室(广州),中国广州
8:南方科技大学高级跨学科研究学院,深圳,中国